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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Agrossilvipastoril. |
Data corrente: |
08/11/2019 |
Data da última atualização: |
08/11/2019 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
TIAGO, A. V.; HOOGERHEIDE, E. S. S.; PEDRI, E. C. M. de; CARDOSO, E. dos S.; PINTO, J. M. A.; PENA, G. F.; ROSSI, A. A. B. |
Afiliação: |
AUANA VICENTE TIAGO, UNEMAT, Alta Floresta, MT; EULALIA SOLER SOBREIRA HOOGERHEIDE, CPAMT; ELIANE CRISTINA MORENO DE PEDRI, UNEMAT, Alta Floresta, MT; ELISA DOS SANTOS CARDOSO, UNEMAT, Alta Floresta, MT; JOYCE MENDES ANDRADE PINTO, CPAMT; GUILHERME FERREIRA PENA, UNEMAT, Alta Floresta, MT; ANA APARECIDA BANDINI ROSSI, UNEMAT, Alta Floresta, MT. |
Título: |
Genetic diversity and population structure of cassava ethno-varieties grown in six municipalities in the state of Mato Grosso, Brazil. |
Ano de publicação: |
2019 |
Fonte/Imprenta: |
Genetics and molecular research, v. 18, n. 4, gmr18357, 2019. |
DOI: |
http://dx.doi.org/10.4238/gmr18357 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Cassava is one of the main energy foods for millions of people, and has a great diversity of ethno-varieties that have specific characteristics often not found in commercial varieties. These constitute a gene pool and therefore a genetic resource that should be conserved and preserved. In this context, the objective of our study was to evaluate the genetic diversity and population structure of ethno-varieties of cassava grown in six municipalities of the state of Mato Grosso, with the aim of characterization and conservation of the varieties found in this area. The study was carried out with 157 samples of cassava. For the molecular analyses, 15 fluorochrome-labeled SSR loci were used. Microsatellite markers amplified a total of 158 alleles. The polymorphism information content for each locus varied from 0.132 (SSRY126) to 0.838 (SSRY47), with a mean of 0.680. The expected and observed heterozygosity showed an average of between 0.717 and 0.688, for SSRY126 and SSRY47, respectively. The heterozygosity values observed were higher than those expected in five of the six populations, generating negative values of the fixation index (-0.070). Among the six populations, Alta Floresta and Cuiabá had the highest percentage of polymorphic loci (100%). The groupings obtained by UPGMA, Structure and PCoA among the six populations were concordant in allocating the individuals into two genetic groups. We found considerable genetic diversity among the samples, evidenced by the high values in the diversity indices. These high values are possibly related to the management of the fields and the exchange of propagative material among the farmers. Therefore, it is proposed that both populations be conserved since they have potential that could be used for genetic improvement of this essential crop. MenosCassava is one of the main energy foods for millions of people, and has a great diversity of ethno-varieties that have specific characteristics often not found in commercial varieties. These constitute a gene pool and therefore a genetic resource that should be conserved and preserved. In this context, the objective of our study was to evaluate the genetic diversity and population structure of ethno-varieties of cassava grown in six municipalities of the state of Mato Grosso, with the aim of characterization and conservation of the varieties found in this area. The study was carried out with 157 samples of cassava. For the molecular analyses, 15 fluorochrome-labeled SSR loci were used. Microsatellite markers amplified a total of 158 alleles. The polymorphism information content for each locus varied from 0.132 (SSRY126) to 0.838 (SSRY47), with a mean of 0.680. The expected and observed heterozygosity showed an average of between 0.717 and 0.688, for SSRY126 and SSRY47, respectively. The heterozygosity values observed were higher than those expected in five of the six populations, generating negative values of the fixation index (-0.070). Among the six populations, Alta Floresta and Cuiabá had the highest percentage of polymorphic loci (100%). The groupings obtained by UPGMA, Structure and PCoA among the six populations were concordant in allocating the individuals into two genetic groups. We found considerable genetic diversity among the samples, evidenced by the high values... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Alta Floresta-MT; Apiacas-MT; Caceres-MT; Cuiaba-MT; Jangada-MT; Pocone-MT; SSR markers. |
Thesagro: |
Manihot Esculenta. |
Thesaurus Nal: |
Genetic variation; Manihot. |
Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/204416/1/2019-cpamt-eulalia-hoogerheide-genetic-diversty-structure-population-ethno-varieties-municipalities-state-mato-grosso.pdf
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Marc: |
LEADER 02794naa a2200325 a 4500 001 2114055 005 2019-11-08 008 2019 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $ahttp://dx.doi.org/10.4238/gmr18357$2DOI 100 1 $aTIAGO, A. V. 245 $aGenetic diversity and population structure of cassava ethno-varieties grown in six municipalities in the state of Mato Grosso, Brazil.$h[electronic resource] 260 $c2019 520 $aCassava is one of the main energy foods for millions of people, and has a great diversity of ethno-varieties that have specific characteristics often not found in commercial varieties. These constitute a gene pool and therefore a genetic resource that should be conserved and preserved. In this context, the objective of our study was to evaluate the genetic diversity and population structure of ethno-varieties of cassava grown in six municipalities of the state of Mato Grosso, with the aim of characterization and conservation of the varieties found in this area. The study was carried out with 157 samples of cassava. For the molecular analyses, 15 fluorochrome-labeled SSR loci were used. Microsatellite markers amplified a total of 158 alleles. The polymorphism information content for each locus varied from 0.132 (SSRY126) to 0.838 (SSRY47), with a mean of 0.680. The expected and observed heterozygosity showed an average of between 0.717 and 0.688, for SSRY126 and SSRY47, respectively. The heterozygosity values observed were higher than those expected in five of the six populations, generating negative values of the fixation index (-0.070). Among the six populations, Alta Floresta and Cuiabá had the highest percentage of polymorphic loci (100%). The groupings obtained by UPGMA, Structure and PCoA among the six populations were concordant in allocating the individuals into two genetic groups. We found considerable genetic diversity among the samples, evidenced by the high values in the diversity indices. These high values are possibly related to the management of the fields and the exchange of propagative material among the farmers. Therefore, it is proposed that both populations be conserved since they have potential that could be used for genetic improvement of this essential crop. 650 $aGenetic variation 650 $aManihot 650 $aManihot Esculenta 653 $aAlta Floresta-MT 653 $aApiacas-MT 653 $aCaceres-MT 653 $aCuiaba-MT 653 $aJangada-MT 653 $aPocone-MT 653 $aSSR markers 700 1 $aHOOGERHEIDE, E. S. S. 700 1 $aPEDRI, E. C. M. de 700 1 $aCARDOSO, E. dos S. 700 1 $aPINTO, J. M. A. 700 1 $aPENA, G. F. 700 1 $aROSSI, A. A. B. 773 $tGenetics and molecular research$gv. 18, n. 4, gmr18357, 2019.
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Registro original: |
Embrapa Agrossilvipastoril (CPAMT) |
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Registros recuperados : 54 | |
1. | | ZANETTI, G. T.; ROSSI, A. A. B.; FIGUEREDO, P. E.; HOOGERHEIDE, E. S. S. Caracterização morfológica de mandiocas crioulas cultivadas em Sinop, Mato Grosso. In: SEMINÁRIO DA PÓS-GRADUAÇÃO STRICTO SENSU DA UNEMAT, 2., 2019, Cáceres, MT. Anais... Cáceres: UNEMAT, 2019. II Sepos.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Agrossilvipastoril. |
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2. | | SILVA, L. G. de O.; HOOGERHEIDE, E. S. S.; ROSSI, A. A. B. Composição da agrobiodiversidade encontrada em comunidades rurais de Nova Guarita, Mato Grosso. In: ENCONTRO DE CIÊNCIA E TECNOLOGIAS AGROSSUSTENTÁVEIS, 4.; JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA AGROSSILVIPASTORIL, 9., 2020, Sinop. Resumos... Brasília, DF: Embrapa, 2020. p. 30.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Agrossilvipastoril. |
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5. | | SILVA, L. G. de O.; HOOGERHEIDE, E. S. S.; ROSSI, A. A. B. Diversidade de plantas mantida por assentados de comunidades rurais de Nova Guarita, Mato Grosso. In: ENCONTRO DE CIÊNCIA E TECNOLOGIAS AGROSSUSTENTÁVEIS, 4.; JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA AGROSSILVIPASTORIL, 9., 2020, Sinop. Resumos... Brasília, DF: Embrapa, 2020. p. 31.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Agrossilvipastoril. |
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7. | | HOOGERHEIDE, E. S. S.; SILVA, L. G. de O.; FIGUEREDO, P.; DARDENGO, J.; ROSSI, A. A. B. Agrobiodiversidade dos quintais da Comunidade São Benedito, Poconé, Mato Grosso. In: ENCONTRO DE CIÊNCIA E TECNOLOGIAS AGROSSUSTENTÁVEIS, 2.; JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA AGROSSILVIPASTORIL, 7., 2018. Sinop, MT. Resumos... Sinop, MT: Embrapa Agrossilpastoril, 2018. p. 127-129.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Agrossilvipastoril. |
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8. | | PEDRI, E. C. M. de; CARDOSO, E. dos S.; HOOGERHEIDE, E. S. S.; ROSSI, A. A. B. Produtividade da parte aérea de mandiocas cacau em diferentes épocas de colheita. In: SEMINÁRIO DE BIODIVERSIDADE E AGROECOSSISTEMAS AMAZÔNICOS: BIODIVERSIDADE E A INTEGRAÇÃO LAVOURA-PECUÁRIA-FLORESTA NOS AGROECOSSISTEMAS AMAZÔNICOS, 7., 2019, Alta Floresta, MT. Anais... Alta Floresta, MT: PPGBioAgro, 2019. não paginado.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Agrossilvipastoril. |
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9. | | TIAGO, A. V.; PEDRI, E. C. M. de; HOOGERHEIDE, E. S. S.; PINTO, J. M. A.; ROSSI, A. A. B. Microssatélite fluorescente na diferenciação de etnovariedades de mandioca cultivadas no município de Alta Floresta, MT. In: ENCONTRO DE CIÊNCIA E TECNOLOGIAS AGROSSUSTENTÁVEIS; JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA AGROSSILVIPASTORIL, 6., 2017, Sinop, MT. Resumos... Sinop, MT: Embrapa Agrossilpastoril, 2017. p. 192-195.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Agrossilvipastoril. |
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11. | | TIAGO, A. V.; PEDRI, E. C. M. de; ROSSI, F. S.; HOOGERHEIDE, E. S. S.; ROSSI, A. A. B. Caracterização fenotípica e molecular de etnovariedades de mandioca. In: JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA AGROSSILVIPASTORIL, 12., 2023. Sinop. Resumos... Brasília, DF: Embrapa, 2023. p. 8. (Embrapa Agrossilvipastoril. Eventos Técnicos & Científicos, 1)Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Agrossilvipastoril. |
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12. | | RONDON, M. J. P.; HOOGERHEIDE, E. S. S.; DARDENGO, J. de F. E.; ROSSI, A. A. B. Espécies e famílias de plantas tuberosas nas comunidades rurais de Carlinda e Paranaíta, Mato Grosso. In: ENCONTRO DE CIÊNCIA E TECNOLOGIAS AGROSSUSTENTÁVEIS, 4.; JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA AGROSSILVIPASTORIL, 9., 2020, Sinop. Resumos... Brasília, DF: Embrapa, 2020. p. 33.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Agrossilvipastoril. |
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13. | | ZANETTI, G. T.; HOOGERHEIDE, E. S. S.; ROSSI, A. A. B.; BEHLING, M.; PINTO, J. M. A. Genetic diversity and phenotypic characterization of Ochroma pyramidale in plantations in Mato Grosso, Brazil. Ciência Florestal, v. 33, n. 1, e65587, 2023.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Agrossilvipastoril. |
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14. | | PEDRI, E. C. M. de; TIAGO, A. V.; CARDOSO, E. dos S.; HOOGERHEIDE, E. S. S.; ROSSI, A. A. B. Diversidade genética de mandiocas cultivadas no norte de mato grosso por meio de microssatélites. In: SEMANA ACADÊMICA DA PESQUISA E INOVAÇÃO; CONGRESSO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 13.; AGINOVTECH; SEMINÁRIO DA PÓS-GRADUAÇÃO DA UNEMAT, 3., 2021, Cáceres, MT. Anais... Cáceres: Unemat, 2022. SAPI; XIII CONIC; AGINOVTECH, e III SEPOSTipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Agrossilvipastoril. |
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15. | | NACHBAR, L. de A.; TIAGO, A. V.; PINTO, J. M. A.; HOOGERHEIDE, E. S. S.; ROSSI, A. A. B. Diversidade de etnovariedades de mandioca cultivadas no Assentamento Wesley Manoel dos Santos - Gleba Mercedes V, Sinop, MT. In: JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA AGROSSILVIPASTORIL, 12., 2023. Sinop. Resumos... Brasília, DF: Embrapa, 2023. p. 41. (Embrapa Agrossilvipastoril. Eventos Técnicos & Científicos, 1)Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Agrossilvipastoril. |
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17. | | GIUSTINA, L. D.; ROSSI, A. A. B.; VIEIRA, F. S.; TARDIN, F. D.; NEVES, L. G.; PEREIRA, T. N. S. Variabilidade genética em genótipos de Teca (Tectona grandis Linn. F.) baseada em marcadores moleculares ISSR e caracteres morfológicos. Ciência Florestal, Santa Maria, v. 27, n. 4, p. 1311-1324, out./dez. 2017.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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18. | | CORDEIRO, A. G. M.; LIMA, J. A.; PENA, G. F.; ROSSI, A. A. B.; GODINHO, V. de P. C.; GUIMARAES, P. E. de O. Análise da diversidade genética de genótipos de milho (Zea mays L.) a partir de caracteres morfoagronômicos. In: SEMANA DA BIOLOGIA, 12., 2019, Alta Floresta. Anais... Alta Floresta: SAMAF, 2019. p. 144-154.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Rondônia. |
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19. | | SILVA, M. de S. A. da; YAMASCHITA, O. M.; ROSSI, A. A. B.; KARSBURG, I. V.; CONCENCO, G.; FELITO, R. A. Potencial alelopático do extrato aquoso das folhas e raízes frescas de Macroptilium lathyroides na germinação e no desenvolvimento inicial de alface. Revista de Ciências Agroambientais, v. 16, n. 1, p. 88-95, 2018.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 4 |
Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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20. | | PEDRI, E. C. M. de; TIAGO, A. V.; CARDOSO, E. dos S.; HOOGERHEIDE, E. S. S.; YAMASHITA, O. M.; ROSSI, A. A. B. Caracterização molecular de etnovariedades de mandioca cultivadas por agricultores no município de Apiacás, MT. In: ENCONTRO DE CIÊNCIA E TECNOLOGIAS AGROSSUSTENTÁVEIS; JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA AGROSSILVIPASTORIL, 6., 2017, Sinop, MT. Resumos... Sinop, MT: Embrapa Agrossilpastoril, 2017. p. 188-191.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Agrossilvipastoril. |
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